МБАЛ „Св. Панталеймон – София“ извършва диагностика, лечение и профилактика на всички групи ендокринни заболявания, както и профилактични прегледи за ранно откриване на хормонални и метаболитни нарушения. Провеждат се всички видове стандартни лабораторни и функционални изследвания на жлезите с вътрешна секреция, както и специфични тестове за базална и стимулирана хормонална секреция.

Болницата разполага с апаратура за ехографско изследване на щитовидната жлеза, паращитовидните и надбъбречните жлези.

В болницата се извършват операции на щитовидната жлеза и паращитовидните жлези.